Analyste en Bioinformatique Senior | Expertise NGS & Python | Télétravail

Notre organisation scientifique de pointe recherche un(e) Analyste en Bioinformatique expérimenté(e) pour rejoindre notre équipe d'innovation. Dans ce rôle stratégique, vous appliquerez votre expertise en bioinformatique et science des données pour résoudre des défis biologiques complexes et transformer des données brutes en insights scientifiques précieux. Responsabilités Clés - Collaborer étroitement avec nos clients pour comprendre leurs objectifs de recherche spécifiques et concevoir des solutions d'analyse bioinformatique personnalisées adaptées à leurs besoins scientifiques. - Développer et implémenter des pipelines computationnels sophistiqués pour le traitement de données biologiques diversifiées, notamment en génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique. - Participer activement au développement, déploiement et optimisation des workflows bioinformatiques pour le traitement des données NGS (RNA-seq unicellulaire et en vrac) utilisant des technologies de pointe. - Effectuer des analyses statistiques rigoureuses et de l'exploration de données avancée pour identifier des motifs, corrélations et biomarqueurs significatifs dans des ensembles de données complexes. - Appliquer des techniques de modélisation statistique et d'apprentissage automatique pour extraire des informations prédictives à partir de jeux de données biologiques volumineux. - Réaliser des contrôles qualité méticuleux, aligner les données d'échantillons au génome de référence, et produire des fichiers de variants (VCFs) et des fichiers VCF génotypés conjointement selon les normes actuelles. - Concevoir et mettre en œuvre des algorithmes personnalisés répondant aux exigences spécifiques des projets scientifiques innovants. - Présenter les résultats et conclusions aux équipes internes et parties prenantes externes avec clarté et précision scientifique. Compétences Requises - Diplôme de niveau Licence ou Master en Informatique, Bioinformatique, ou discipline connexe, avec expérience pratique avérée dans le développement et l'analyse de workflows NGS. - Expérience significative avec les environnements GxP, Genedata Selector et applications NGS dans le domaine de la thérapie cellulaire, démontrant une maîtrise technique dans ces domaines spécialisés. - Compréhension approfondie des concepts, algorithmes et outils bioinformatiques modernes appliqués à l'analyse de données biologiques complexes. - Expérience démontrée dans l'analyse de données génomiques, transcriptomiques ou protéomiques à haut débit, avec applications concrètes dans un contexte de recherche ou clinique. - Maîtrise confirmée dans la création et l'optimisation de pipelines de traitement de données RNA-seq unicellulaire et en vrac utilisant les technologies actuelles. - Compétences avancées en développement de pipelines utilisant Nextflow (version 23.10+), Cromwell, ou autres frameworks reconnus dans le secteur bioinformatique. - Excellente maîtrise du langage de programmation Python (3.11+) et expérience approfondie avec les bibliothèques bioinformatiques essentielles (Biopython, Pandas, NumPy, SciPy, Scikit-learn). - Connaissance approfondie des techniques d'analyse statistique, d'apprentissage automatique et d'exploration de données appliquées aux sciences biologiques. - Niveau d'anglais C1 ou supérieur, permettant une communication efficace dans un environnement scientifique international. Atouts Appréciés - Expérience avancée dans l'analyse de données de séquençage nouvelle génération (NGS) et l'identification de variants génétiques utilisant des outils modernes. - Connaissances solides en bioinformatique structurale et modélisation moléculaire appliquées à des projets de recherche concrets. - Familiarité approfondie avec les plateformes de cloud computing (AWS, Google Cloud, Azure) et les frameworks d'analyse de données massives (Spark, Hadoop). - Expérience pratique dans le déploiement et l'orchestration de pipelines sur AWS, avec optimisation des ressources et des coûts. - Compétences avancées en visualisation de données biologiques complexes utilisant des outils spécialisés (R/ggplot2, Matplotlib, Seaborn, Plotly). - Excellentes aptitudes en communication scientifique et compétences interpersonnelles, facilitant la collaboration au sein d'équipes pluridisciplinaires et la transmission de concepts complexes à des interlocuteurs non techniques. Pourquoi Nous Rejoindre Intégrez une équipe à la pointe de l'innovation bioinformatique où votre expertise contribuera directement à des avancées scientifiques significatives. Nous offrons un environnement de travail flexible, des projets stimulants à fort impact, et l'opportunité de perfectionner continuellement vos compétences techniques dans le domaine en rapide évolution de la bioinformatique. Notre culture favorise l'excellence analytique et l'innovation responsable pour faire progresser la recherche scientifique.